ขั้นตอนแรกคือการเตรียมเนื้อไก่  สำหรับการทำต้มยำไก่น้ำใสแนะนำให้เลือกใช้ไก่ส่วนสะโพกหรือส่วนน่องติดสะโพกเพราะเป็นส่วนที่ทำให้ได้รสสัมผัสแบบนุ่มละมุนไม่เหนียวและไม่แห้งจนเกินพอดี นำไก่ทั้งชิ้นมาเลาะกระดูกออกจนหมด ล้างทำความสะอาดเนื้อไก่ จากนั้นหั่นเนื้อไก่ออกเป็นชิ้นพอดีคำหรือประมาณ 2-3 เซนติเมตร ควรหั่นติดหนังไก่เพื่อให้ตอนทานได้ความชุ่มฉ่ำแบบเต็มคำ 

เคล็ดลับ: ในขั้นตอนของการล้างเนื้อไก่แนะนำ ให้ใช้น้ำเปล่าสะอาดผสมเกลือป่นเล็กน้อยเพื่อขจัดกลิ่นคาวและขจัดคราบไขมันบนเนื้อไก่และควรล้างทั้งก่อนหั่นและหลังหั่นเป็นชิ้น 

การทำต้มยำน้ำใสสิ่งที่จะขาดไปไม่ได้เลยคือเครื่องสำหรับทำต้มยำ ได้แก่ ข่า ตะไคร้ ใบมะกรูด รากผักชี หอมแดง กระเทียม และมะเขือเทศ  

นำเครื่องต้มยำทุกชนิดไปล้างทำความสะอาด หั่นข่าให้เป็นแว่นบาง ๆ บุบตะไคร้ให้แตกเล็กน้อย ทำการสไลด์เฉียงเป็นท่อนประมาณ 3 เซนติเมตร จากนั้นดึงแกนกลางของใบมะกรูดออก ปอกเปลือกหอมแดงและกระเทียมออกจนหมดล้างน้ำอีกครั้ง บุบเล็กน้อยให้พอแตก สุดท้ายมะเขือเทศหั่นครึ่งหากเลือกใช้มะเขือเทศลูกใหญ่ให้หั่นเป็นเสี้ยว 6-8 เสี้ยวต่อลูก  

เครื่องสมุนไพรต้มยำต่าง ๆ ที่ให้ทำการบุบก่อนก็เพื่อเปิดให้น้ำมันหอมระเหยของสมุนไพรออกมา จะได้ต้มยำที่มีกลิ่นหอมสมุนไพรน่ารับประทาน 

เคล็ดลับ: มะเขือเทศสามารถเลือกใช้ชนิดใดก็ได้ ในสูตรนี้ใช้มะเขือเทศราชินีหั่นครึ่งลูก แต่แนะนำว่าควรใส่มะเขือเทศลงไปด้วย เพราะเป็นการเพิ่มรสชาติให้ต้มยำไก่น้ำใสมีความเปรี้ยวหวานกลมกล่อมและหอมชวนทานมากขึ้น 

เตรียมน้ำใส่หม้อประมาณ 700 มิลลิลิตร ตั้งด้วยไฟกลางค่อนไปทางแรง รอจนกว่าน้ำจะเดือด ให้เตรียมรากผักชีมาล้างทำความสะอาดเศษดินจนหมด บุบรากผักชีเล็กน้อย ใส่ลงไปในหม้อที่มีน้ำเดือด ตามด้วยใส่เนื้อไก่หั่นชิ้นที่พักไว้ ปิดฝาหม้อทิ้งไว้สักพัก  

เคล็ดลับ: ในระหว่างที่รอน้ำในหม้อเดือดหากภายในหม้อมีฟองที่เกิดจากคราบเลือดคราบไขมันของไก่ ควรตักออกให้ได้มากที่สุด เพื่อป้องกันไม่ให้น้ำต้มยำขุ่น

เมื่อน้ำในหม้อเดือดดีแล้วหรือเนื้อไก่สุกเต็มที่แล้วให้ใส่เครื่องต้มยำทั้งหมดลงไป ทั้งข่าหั่นแว่น ตะไคร้ กระเทียม หอมแดง ใบมะกรูด และมะเขือเทศ ทิ้งไว้จนกว่าน้ำจะเดือด ระหว่างที่รอน้ำเดือดอีกครั้งไม่ 

ควรคนในหม้อต้มยำเพราะจะทำให้น้ำขุ่นได้ เมื่อน้ำเดือดให้ใส่เครื่องปรุงลงในต้มยำไก่น้ำใส เติมน้ำปลา พริกแห้งป่น และที่ขาดไม่ได้คือ อายิโนะโมะโต๊ะ

เคล็ดลับ: สำหรับขั้นตอนของการเติมน้ำมะนาวควรปิดเตาก่อนแล้วจึงใส่น้ำมะนาวลงใน หม้อต้มยำ เพื่อลดรสชาติขมปลายลิ้นจากการที่น้ำมะนาวสัมผัสความร้อน หรือหากใครชอบรสชาติของมะขามเปียกสามารถเปลี่ยนน้ำมะนาวเป็นน้ำมะขามเปียกได้ แต่การใช้น้ำมะขามเปียกแทนมะนาว สีของน้ำต้มยำจะขุ่นกว่าเล็กน้อย

 5.  เตรียมเสิร์ฟ

หลังจากใส่น้ำมะนาวลงไปในต้มยำไก่น้ำใสแล้ว ชิมรสชาติอีกครั้ง เมื่อรสชาติเป็นที่ถูกใจแล้วให้ใส่ใบกะเพราและผักชีฝรั่งซอยตามลงไป หากใครต้องการความเผ็ดจัดจ้านมากขึ้นให้นำพริกชี้ฟ้าแห้งไปเจียวจนกรอบและโรยบนต้มยำเป็นขั้นตอนสุดท้าย ยกลงจากเตาตักใส่ถ้วยพร้อมเสิร์ฟ  

เคล็ดลับ: การใส่ใบกะเพราลงไปในหม้อต้มยำสามารถใส่ได้ทั้งใบและดอกกะเพราเพื่อเพิ่มกลิ่นสัมผัสให้มีความหอมของสมุนไพร ที่สำคัญใบกะเพราะยังช่วยเพิ่มรสชาติของต้มยำไก่ให้มีเอกลักษณ์เพิ่มมากขึ้น 

สำหรับเมนูต้มยำไก่น้ำใสถือว่าเป็นอีกหนึ่งเมนูอาหารไทยภาคกลางที่สามารถทำได้ง่าย หาวัตถุดิบได้ง่าย ทำทานได้บ่อยแบบไม่มีเบื่อ หรือหากใครอยากทานต้มยำไก่บ้าน ต้มยำไก่ใส่เครื่องใน ก็สามารถใช้สูตรนี้ได้เช่นกัน ทานกับข้าวสวยร้อน ๆ หรือทานเล่นเปล่า ๆ ก็อร่อยไม่แพ้กัน